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南宋偏安，與金、元對峙，形成繼南北朝之後中國歷史上又一次南北分治的局面，由此帶來道教發展的新格局，宗派紛起。南方以符籙三山為主，又有[[神霄]]、[[清微]]、[[淨明道]]等派，還有所謂金丹派南宗。北方產生了[[太一教]]、[[大道教]]、[[全真道]]等新道派。這是道教史上的又一個轉折時期，教義教制都呈現了新的面貌，內丹學大為流行，形成以煉內丹為主旨的道派，而符籙派吸收內丹術，形成新的符籙道派，道教再次出現改革的氣象。這次改革不像南北朝是要完成從民間到官方的任務，而是道教自身教義教制的革新，並因此形成新道派。