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*第七卷〈忠誥〉、第八卷〈孝誥〉，多稱引宋人事跡，實為元以後人所作。

*第九、十卷《前八品仙經》、第十一卷《後八品仙經》、第十二卷《五品仙經》、十三至十五卷《清微三品經》、第十六至十八卷《參同契》、第十九卷《聖德諸品經》、第二十卷《金丹直指諸品經》、二十一卷《醒心經》、二十二卷《度厄救劫救苦滌氛四神咒》、第二十三卷《雪過修真懺》、第二十四卷《玉樞經贊》、第二十五、二十六卷《葫頭集》、第二十七、二十八卷《涵三雜詠》和《涵三語錄》，以上皆為繼明《呂祖志》問世後續增的呂洞賓的著作。其中如《涵三雜詠》等皆出自乩筆，《玉樞經贊》等已見《[[道藏輯要]]》。

*第三十一卷〈敲爻歌、沁園春注解〉，收傳為呂洞賓所撰《敲爻歌》注一種，明錢道華著《沁園春》注二種，分別為蕭廷之、俞琰著。

*第三十二卷《呂祖誥》，附柳、葛、王諸仙真誥。